نفى الشيخ عبد المجيد الزنداني ما ورد في مقابلة الرئيس السابق علي عبد الله صالح، بخصوص إنشاء جامعة الإيمان، والذي قال بأن إنشاءها كان على خلفية مشاركة حزب الإصلاح في حرب الإنفصال.
وأكد الشيخ الزنداني، في بيان خاص نشره ابنه الدكتور عبدالله عبدالمجيد الزنداني على صفحته الشخصية أن إنشاء الجامعة كان بعد تنازله عن عضوية مجلس الرئاسة الذي كان يرأسه صالح وقتها وأنها أنشئت بدون أي تكليف على الدولة.